Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA8P53708 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms