Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CENPAP49450 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CENPAP49450 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CENPAP49450 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CENPAP49450 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CENPAP49450 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CENPAP49450 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPAP49450 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPAP49450 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPAP49450 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPAP49450 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPAP49450 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPAP49450 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPAP49450 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPAP49450 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPAP49450 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPAP49450 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPAP49450 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPAP49450 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPAP49450 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPAP49450 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPAP49450 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPAP49450 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPAP49450 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CENPAP49450 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CENPAP49450 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPAP49450 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CENPAP49450 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPAP49450 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CENPAP49450 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CENPAP49450 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPAP49450 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CENPAP49450 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPAP49450 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CENPAP49450 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPAP49450 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPAP49450 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPAP49450 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPAP49450 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CENPAP49450 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPAP49450 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CENPAP49450 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPAP49450 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPAP49450 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPAP49450 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPAP49450 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPAP49450 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPAP49450 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPAP49450 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPAP49450 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPAP49450 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPAP49450 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPAP49450 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPAP49450 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPAP49450 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPAP49450 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPAP49450 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPAP49450 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPAP49450 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPAP49450 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPAP49450 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CENPAP49450 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPAP49450 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPAP49450 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPAP49450 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPAP49450 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPAP49450 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPAP49450 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPAP49450 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPAP49450 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPAP49450 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPAP49450 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPAP49450 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPAP49450 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPAP49450 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPAP49450 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPAP49450 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPAP49450 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPAP49450 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPAP49450 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPAP49450 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPAP49450 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPAP49450 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CENPAP49450 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPAP49450 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPAP49450 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPAP49450 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPAP49450 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPAP49450 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPAP49450 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPAP49450 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPAP49450 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPAP49450 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPAP49450 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPAP49450 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPAP49450 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPAP49450 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPAP49450 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPAP49450 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CENPAP49450 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms