Protein–RNA interactions for Protein: P49427

CDC34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC34P49427 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC34P49427 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC34P49427 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC34P49427 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC34P49427 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC34P49427 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC34P49427 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC34P49427 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC34P49427 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC34P49427 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC34P49427 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC34P49427 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC34P49427 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC34P49427 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC34P49427 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC34P49427 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC34P49427 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC34P49427 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC34P49427 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC34P49427 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC34P49427 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC34P49427 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC34P49427 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC34P49427 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC34P49427 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC34P49427 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC34P49427 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDC34P49427 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDC34P49427 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDC34P49427 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC34P49427 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC34P49427 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC34P49427 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC34P49427 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC34P49427 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC34P49427 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC34P49427 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC34P49427 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC34P49427 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC34P49427 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC34P49427 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC34P49427 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC34P49427 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC34P49427 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC34P49427 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC34P49427 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC34P49427 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC34P49427 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC34P49427 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC34P49427 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC34P49427 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC34P49427 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC34P49427 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC34P49427 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC34P49427 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC34P49427 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC34P49427 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC34P49427 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC34P49427 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC34P49427 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC34P49427 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC34P49427 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC34P49427 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC34P49427 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC34P49427 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC34P49427 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC34P49427 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC34P49427 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC34P49427 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC34P49427 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC34P49427 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC34P49427 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC34P49427 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC34P49427 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC34P49427 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC34P49427 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC34P49427 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC34P49427 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC34P49427 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC34P49427 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC34P49427 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC34P49427 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC34P49427 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC34P49427 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC34P49427 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC34P49427 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC34P49427 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC34P49427 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC34P49427 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC34P49427 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC34P49427 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC34P49427 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC34P49427 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC34P49427 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC34P49427 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC34P49427 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC34P49427 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC34P49427 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC34P49427 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC34P49427 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms