Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FNTBP49356 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FNTBP49356 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FNTBP49356 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FNTBP49356 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FNTBP49356 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FNTBP49356 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FNTBP49356 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FNTBP49356 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FNTBP49356 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FNTBP49356 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FNTBP49356 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FNTBP49356 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FNTBP49356 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FNTBP49356 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FNTBP49356 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FNTBP49356 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FNTBP49356 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FNTBP49356 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FNTBP49356 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FNTBP49356 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FNTBP49356 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FNTBP49356 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FNTBP49356 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FNTBP49356 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FNTBP49356 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FNTBP49356 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FNTBP49356 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FNTBP49356 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FNTBP49356 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FNTBP49356 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FNTBP49356 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FNTBP49356 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FNTBP49356 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FNTBP49356 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FNTBP49356 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FNTBP49356 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FNTBP49356 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FNTBP49356 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FNTBP49356 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FNTBP49356 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FNTBP49356 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FNTBP49356 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FNTBP49356 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FNTBP49356 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FNTBP49356 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FNTBP49356 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FNTBP49356 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FNTBP49356 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FNTBP49356 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FNTBP49356 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FNTBP49356 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FNTBP49356 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FNTBP49356 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FNTBP49356 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FNTBP49356 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FNTBP49356 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FNTBP49356 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FNTBP49356 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNTBP49356 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNTBP49356 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNTBP49356 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNTBP49356 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNTBP49356 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNTBP49356 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNTBP49356 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNTBP49356 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNTBP49356 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNTBP49356 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNTBP49356 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FNTBP49356 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FNTBP49356 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNTBP49356 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FNTBP49356 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNTBP49356 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FNTBP49356 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNTBP49356 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNTBP49356 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNTBP49356 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNTBP49356 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FNTBP49356 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNTBP49356 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNTBP49356 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNTBP49356 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FNTBP49356 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNTBP49356 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNTBP49356 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FNTBP49356 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FNTBP49356 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNTBP49356 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNTBP49356 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNTBP49356 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNTBP49356 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNTBP49356 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNTBP49356 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FNTBP49356 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNTBP49356 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNTBP49356 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNTBP49356 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FNTBP49356 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms