Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMAN1P49257 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LMAN1P49257 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms