Protein–RNA interactions for Protein: P48643

CCT5, T-complex protein 1 subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT5P48643 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCT5P48643 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCT5P48643 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCT5P48643 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCT5P48643 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCT5P48643 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCT5P48643 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCT5P48643 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCT5P48643 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCT5P48643 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCT5P48643 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCT5P48643 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCT5P48643 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCT5P48643 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCT5P48643 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCT5P48643 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCT5P48643 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCT5P48643 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCT5P48643 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCT5P48643 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCT5P48643 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCT5P48643 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCT5P48643 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCT5P48643 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCT5P48643 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCT5P48643 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCT5P48643 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCT5P48643 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCT5P48643 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCT5P48643 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCT5P48643 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCT5P48643 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCT5P48643 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCT5P48643 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCT5P48643 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCT5P48643 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCT5P48643 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCT5P48643 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCT5P48643 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCT5P48643 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCT5P48643 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCT5P48643 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCT5P48643 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCT5P48643 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCT5P48643 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCT5P48643 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCT5P48643 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCT5P48643 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCT5P48643 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCT5P48643 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCT5P48643 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCT5P48643 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCT5P48643 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCT5P48643 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCT5P48643 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCT5P48643 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCT5P48643 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCT5P48643 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCT5P48643 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCT5P48643 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCT5P48643 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCT5P48643 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCT5P48643 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCT5P48643 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCT5P48643 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCT5P48643 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCT5P48643 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCT5P48643 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCT5P48643 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCT5P48643 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCT5P48643 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCT5P48643 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCT5P48643 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCT5P48643 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCT5P48643 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCT5P48643 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCT5P48643 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCT5P48643 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCT5P48643 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCT5P48643 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCT5P48643 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCT5P48643 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCT5P48643 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCT5P48643 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCT5P48643 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCT5P48643 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCT5P48643 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCT5P48643 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCT5P48643 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCT5P48643 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCT5P48643 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCT5P48643 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCT5P48643 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCT5P48643 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCT5P48643 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCT5P48643 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCT5P48643 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCT5P48643 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCT5P48643 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCT5P48643 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms