Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRCC3P46736 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRCC3P46736 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRCC3P46736 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRCC3P46736 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BRCC3P46736 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRCC3P46736 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRCC3P46736 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BRCC3P46736 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRCC3P46736 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRCC3P46736 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRCC3P46736 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRCC3P46736 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRCC3P46736 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRCC3P46736 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms