Protein–RNA interactions for Protein: P46093

GPR4, G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR4P46093 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR4P46093 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR4P46093 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR4P46093 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR4P46093 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR4P46093 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR4P46093 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR4P46093 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR4P46093 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR4P46093 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR4P46093 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR4P46093 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR4P46093 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR4P46093 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR4P46093 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR4P46093 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR4P46093 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR4P46093 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR4P46093 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR4P46093 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR4P46093 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR4P46093 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR4P46093 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR4P46093 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR4P46093 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR4P46093 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR4P46093 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR4P46093 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPR4P46093 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPR4P46093 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPR4P46093 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPR4P46093 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPR4P46093 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPR4P46093 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPR4P46093 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPR4P46093 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPR4P46093 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPR4P46093 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPR4P46093 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPR4P46093 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPR4P46093 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPR4P46093 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPR4P46093 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPR4P46093 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPR4P46093 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPR4P46093 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPR4P46093 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPR4P46093 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPR4P46093 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPR4P46093 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPR4P46093 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPR4P46093 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPR4P46093 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPR4P46093 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPR4P46093 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPR4P46093 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPR4P46093 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPR4P46093 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPR4P46093 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPR4P46093 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPR4P46093 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPR4P46093 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPR4P46093 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPR4P46093 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPR4P46093 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPR4P46093 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPR4P46093 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPR4P46093 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPR4P46093 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPR4P46093 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPR4P46093 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GPR4P46093 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPR4P46093 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GPR4P46093 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPR4P46093 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPR4P46093 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPR4P46093 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPR4P46093 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPR4P46093 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPR4P46093 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPR4P46093 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPR4P46093 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPR4P46093 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPR4P46093 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPR4P46093 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPR4P46093 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPR4P46093 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPR4P46093 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPR4P46093 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPR4P46093 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GPR4P46093 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPR4P46093 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPR4P46093 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GPR4P46093 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GPR4P46093 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPR4P46093 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPR4P46093 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPR4P46093 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPR4P46093 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPR4P46093 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms