Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
USP5P45974 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP5P45974 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP5P45974 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
USP5P45974 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP5P45974 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP5P45974 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
USP5P45974 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP5P45974 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP5P45974 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP5P45974 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP5P45974 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP5P45974 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
USP5P45974 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
USP5P45974 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
USP5P45974 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP5P45974 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP5P45974 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP5P45974 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP5P45974 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP5P45974 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP5P45974 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
USP5P45974 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP5P45974 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP5P45974 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP5P45974 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP5P45974 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP5P45974 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP5P45974 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
USP5P45974 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP5P45974 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP5P45974 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP5P45974 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP5P45974 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP5P45974 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP5P45974 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
USP5P45974 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP5P45974 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP5P45974 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP5P45974 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
USP5P45974 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP5P45974 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP5P45974 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP5P45974 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP5P45974 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP5P45974 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP5P45974 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP5P45974 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP5P45974 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
USP5P45974 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP5P45974 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP5P45974 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP5P45974 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP5P45974 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP5P45974 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP5P45974 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP5P45974 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP5P45974 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP5P45974 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP5P45974 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP5P45974 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP5P45974 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
USP5P45974 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP5P45974 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP5P45974 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP5P45974 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP5P45974 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP5P45974 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP5P45974 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP5P45974 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP5P45974 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP5P45974 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP5P45974 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP5P45974 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP5P45974 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP5P45974 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP5P45974 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP5P45974 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP5P45974 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP5P45974 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP5P45974 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP5P45974 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP5P45974 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP5P45974 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP5P45974 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP5P45974 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP5P45974 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP5P45974 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP5P45974 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP5P45974 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP5P45974 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP5P45974 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP5P45974 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP5P45974 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP5P45974 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP5P45974 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP5P45974 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP5P45974 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP5P45974 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP5P45974 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms