Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GRIK1P39086 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIK1P39086 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms