Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGCXP38435 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGCXP38435 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGCXP38435 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGCXP38435 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGCXP38435 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGCXP38435 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GGCXP38435 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGCXP38435 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGCXP38435 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGCXP38435 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGCXP38435 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGCXP38435 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGCXP38435 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GGCXP38435 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GGCXP38435 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GGCXP38435 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GGCXP38435 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GGCXP38435 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GGCXP38435 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GGCXP38435 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GGCXP38435 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GGCXP38435 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GGCXP38435 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GGCXP38435 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GGCXP38435 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GGCXP38435 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GGCXP38435 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GGCXP38435 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GGCXP38435 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GGCXP38435 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GGCXP38435 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GGCXP38435 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GGCXP38435 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GGCXP38435 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GGCXP38435 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GGCXP38435 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GGCXP38435 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GGCXP38435 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GGCXP38435 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GGCXP38435 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGCXP38435 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGCXP38435 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGCXP38435 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GGCXP38435 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGCXP38435 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGCXP38435 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGCXP38435 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGCXP38435 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GGCXP38435 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GGCXP38435 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGCXP38435 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGCXP38435 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGCXP38435 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGCXP38435 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GGCXP38435 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGCXP38435 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGCXP38435 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGCXP38435 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGCXP38435 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGCXP38435 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGCXP38435 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGCXP38435 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GGCXP38435 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGCXP38435 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGCXP38435 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGCXP38435 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGCXP38435 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGCXP38435 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GGCXP38435 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGCXP38435 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGCXP38435 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGCXP38435 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGCXP38435 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGCXP38435 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGCXP38435 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGCXP38435 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGCXP38435 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGCXP38435 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GGCXP38435 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGCXP38435 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGCXP38435 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGCXP38435 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGCXP38435 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GGCXP38435 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GGCXP38435 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGCXP38435 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGCXP38435 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGCXP38435 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGCXP38435 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGCXP38435 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GGCXP38435 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GGCXP38435 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGCXP38435 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGCXP38435 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGCXP38435 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGCXP38435 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGCXP38435 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGCXP38435 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGCXP38435 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms