Protein–RNA interactions for Protein: P36980

CFHR2, Complement factor H-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR2P36980 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFHR2P36980 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFHR2P36980 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFHR2P36980 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFHR2P36980 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFHR2P36980 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFHR2P36980 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFHR2P36980 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFHR2P36980 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFHR2P36980 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFHR2P36980 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFHR2P36980 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFHR2P36980 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFHR2P36980 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFHR2P36980 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFHR2P36980 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFHR2P36980 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFHR2P36980 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFHR2P36980 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CFHR2P36980 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFHR2P36980 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFHR2P36980 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFHR2P36980 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFHR2P36980 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFHR2P36980 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFHR2P36980 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFHR2P36980 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFHR2P36980 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFHR2P36980 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFHR2P36980 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFHR2P36980 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFHR2P36980 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFHR2P36980 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFHR2P36980 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFHR2P36980 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFHR2P36980 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CFHR2P36980 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFHR2P36980 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFHR2P36980 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFHR2P36980 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFHR2P36980 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFHR2P36980 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFHR2P36980 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFHR2P36980 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFHR2P36980 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFHR2P36980 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFHR2P36980 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CFHR2P36980 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CFHR2P36980 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms