Protein–RNA interactions for Protein: P36130

CAF4, CCR4-associated factor 4, yeastyeast

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Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CAF4P36130 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.49□□□□□ -2.01
CAF4P36130 YNL203CYNL203C 612 nt2.49□□□□□ -2.01
CAF4P36130 PIN3YPR154W 648 nt2.49□□□□□ -2.01
CAF4P36130 TMA64YDR117C 1698 nt2.49□□□□□ -2.01
CAF4P36130 SOK1YDR006C 2706 nt2.48□□□□□ -2.01
CAF4P36130 YJL132WYJL132W 2253 nt2.48□□□□□ -2.01
CAF4P36130 YGR073CYGR073C 372 nt2.48□□□□□ -2.01
CAF4P36130 MRPL38YKL170W 417 nt2.48□□□□□ -2.01
CAF4P36130 PSY3YLR376C 729 nt2.48□□□□□ -2.01
CAF4P36130 YNR062CYNR062C 984 nt2.48□□□□□ -2.01
CAF4P36130 MSN1YOL116W 1149 nt2.48□□□□□ -2.01
CAF4P36130 MSS4YDR208W 2340 nt2.48□□□□□ -2.01
CAF4P36130 ORC2YBR060C 1863 nt2.48□□□□□ -2.01
CAF4P36130 MRD1YPR112C 2664 nt2.47□□□□□ -2.01
CAF4P36130 ARP8YOR141C 2646 nt2.47□□□□□ -2.01
CAF4P36130 SAK1YER129W 3429 nt2.47□□□□□ -2.01
CAF4P36130 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt2.47□□□□□ -2.01
CAF4P36130 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.47□□□□□ -2.01
CAF4P36130 YKL100CYKL100C 1764 nt2.47□□□□□ -2.01
CAF4P36130 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.47□□□□□ -2.01
CAF4P36130 RRP1YDR087C 837 nt2.47□□□□□ -2.01
CAF4P36130 RPB9YGL070C 369 nt2.47□□□□□ -2.01
CAF4P36130 YIL089WYIL089W 618 nt2.47□□□□□ -2.01
CAF4P36130 YKL066WYKL066W 444 nt2.47□□□□□ -2.01
CAF4P36130 USB1YLR132C 873 nt2.47□□□□□ -2.01
CAF4P36130 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt2.47□□□□□ -2.01
CAF4P36130 YBL028CYBL028C 321 nt2.47□□□□□ -2.01
CAF4P36130 YOR331CYOR331C 558 nt2.47□□□□□ -2.01
CAF4P36130 RPS12YOR369C 432 nt2.47□□□□□ -2.01
CAF4P36130 ATP3YBR039W 936 nt2.47□□□□□ -2.01
CAF4P36130 YML096WYML096W 1578 nt2.47□□□□□ -2.01
CAF4P36130 DUN1YDL101C 1542 nt2.47□□□□□ -2.01
CAF4P36130 PHO2YDL106C 1680 nt2.47□□□□□ -2.01
CAF4P36130 PSD2YGR170W 3417 nt2.46□□□□□ -2.01
CAF4P36130 YDL050CYDL050C 372 nt2.46□□□□□ -2.02
CAF4P36130 CSM2YIL132C 642 nt2.46□□□□□ -2.02
CAF4P36130 DAD2YKR083C 402 nt2.46□□□□□ -2.02
CAF4P36130 APD1YBR151W 951 nt2.46□□□□□ -2.02
CAF4P36130 SUL1YBR294W 2580 nt2.46□□□□□ -2.02
CAF4P36130 RDS2YPL133C 1341 nt2.45□□□□□ -2.02
CAF4P36130 HBT1YDL223C 3141 nt2.45□□□□□ -2.02
CAF4P36130 RRP42YDL111C 798 nt2.45□□□□□ -2.02
CAF4P36130 LSM6YDR378C 261 nt2.45□□□□□ -2.02
CAF4P36130 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.45□□□□□ -2.02
CAF4P36130 BAT1YHR208W 1182 nt2.45□□□□□ -2.02
CAF4P36130 YIL054WYIL054W 318 nt2.45□□□□□ -2.02
CAF4P36130 PRE8YML092C 753 nt2.45□□□□□ -2.02
CAF4P36130 RPL23AYBL087C 414 nt2.45□□□□□ -2.02
CAF4P36130 POS5YPL188W 1245 nt2.45□□□□□ -2.02
CAF4P36130 PBS2YJL128C 2007 nt2.45□□□□□ -2.02
CAF4P36130 YCK2YNL154C 1641 nt2.45□□□□□ -2.02
CAF4P36130 YGL176CYGL176C 1665 nt2.44□□□□□ -2.02
CAF4P36130 YHR097CYHR097C 1101 nt2.44□□□□□ -2.02
CAF4P36130 PEX18YHR160C 852 nt2.44□□□□□ -2.02
CAF4P36130 YNL043CYNL043C 321 nt2.44□□□□□ -2.02
CAF4P36130 COS1YNL336W 1146 nt2.44□□□□□ -2.02
CAF4P36130 YOR055WYOR055W 435 nt2.44□□□□□ -2.02
CAF4P36130 DNA2YHR164C 4569 nt2.44□□□□□ -2.02
CAF4P36130 SIN3YOL004W 4611 nt2.43□□□□□ -2.02
CAF4P36130 CSF1YLR087C 8877 nt2.43□□□□□ -2.02
CAF4P36130 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.43□□□□□ -2.02
CAF4P36130 YHR213WYHR213W 597 nt2.43□□□□□ -2.02
CAF4P36130 YAR062WYAR062W 597 nt2.43□□□□□ -2.02
CAF4P36130 VMA6YLR447C 1038 nt2.43□□□□□ -2.02
CAF4P36130 YBL094CYBL094C 333 nt2.43□□□□□ -2.02
CAF4P36130 YOR050CYOR050C 348 nt2.43□□□□□ -2.02
CAF4P36130 RRG7YOR305W 729 nt2.43□□□□□ -2.02
CAF4P36130 YPL276WYPL276W 438 nt2.43□□□□□ -2.02
CAF4P36130 RLI1YDR091C 1827 nt2.42□□□□□ -2.02
CAF4P36130 RED1YLR263W 2484 nt2.42□□□□□ -2.02
CAF4P36130 MUS81YDR386W 1899 nt2.42□□□□□ -2.02
CAF4P36130 EAP1YKL204W 1899 nt2.42□□□□□ -2.02
CAF4P36130 YIL080WYIL080W 4722 nt2.42□□□□□ -2.02
CAF4P36130 JIP5YPR169W 1479 nt2.42□□□□□ -2.02
CAF4P36130 PCL9YDL179W 915 nt2.42□□□□□ -2.02
CAF4P36130 TAN1YGL232W 870 nt2.42□□□□□ -2.02
CAF4P36130 TCD1YHR003C 1290 nt2.42□□□□□ -2.02
CAF4P36130 GPI14YJR013W 1212 nt2.42□□□□□ -2.02
CAF4P36130 RDN58-1RDN58-1 158 nt2.42□□□□□ -2.02
CAF4P36130 RDN58-2RDN58-2 158 nt2.42□□□□□ -2.02
CAF4P36130 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt2.42□□□□□ -2.02
CAF4P36130 RPB8YOR224C 441 nt2.42□□□□□ -2.02
CAF4P36130 RRD2YPL152W 1077 nt2.42□□□□□ -2.02
CAF4P36130 SWD3YBR175W 948 nt2.42□□□□□ -2.02
CAF4P36130 KEL2YGR238C 2649 nt2.42□□□□□ -2.02
CAF4P36130 VPS13YLL040C 9435 nt2.42□□□□□ -2.02
CAF4P36130 SLN1YIL147C 3663 nt2.42□□□□□ -2.02
CAF4P36130 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt2.42□□□□□ -2.02
CAF4P36130 GCD10YNL062C 1437 nt2.42□□□□□ -2.02
CAF4P36130 YKR078WYKR078W 1758 nt2.41□□□□□ -2.02
CAF4P36130 RTN1YDR233C 888 nt2.41□□□□□ -2.02
CAF4P36130 YDR535CYDR535C 501 nt2.41□□□□□ -2.02
CAF4P36130 RTT105YER104W 627 nt2.41□□□□□ -2.02
CAF4P36130 PRP18YGR006W 756 nt2.41□□□□□ -2.02
CAF4P36130 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.41□□□□□ -2.02
CAF4P36130 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.41□□□□□ -2.02
CAF4P36130 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.41□□□□□ -2.02
CAF4P36130 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.41□□□□□ -2.02
CAF4P36130 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.41□□□□□ -2.02
CAF4P36130 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.41□□□□□ -2.02
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