Protein–RNA interactions for Protein: P36068

SHE2, SWI5-dependent HO expression protein 2, yeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 246 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SHE2	P36068	YKL033W-A	YKL033W-A	711 nt		2.27	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	YLR290C	YLR290C	834 nt		2.27	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	TAF4	YMR005W	1167 nt		2.27	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	ACM1	YPL267W	630 nt		2.27	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	VHR2	YER064C	1518 nt		2.27	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	SGM1	YJR134C	2124 nt		2.26	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	PDR1	YGL013C	3207 nt		2.26	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	RRP42	YDL111C	798 nt		2.26	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	SCL1	YGL011C	759 nt		2.26	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	EDC1	YGL222C	528 nt		2.26	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	PTI1	YGR156W	1278 nt		2.26	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	BET3	YKR068C	582 nt		2.26	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	RNH203	YLR154C	333 nt		2.26	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	BLS1	YLR408C	369 nt		2.26	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	YMR194C-A	YMR194C-A	225 nt		2.26	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	KTI11	YBL071W-A	249 nt		2.26	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	YNL184C	YNL184C	327 nt		2.26	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	YOR055W	YOR055W	435 nt		2.26	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	IAH1	YOR126C	717 nt		2.26	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	TPO5	YKL174C	1857 nt		2.26	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	UTP15	YMR093W	1542 nt		2.26	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	SVL3	YPL032C	2478 nt		2.26	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	YCG1	YDR325W	3108 nt		2.25	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	SAS2	YMR127C	1017 nt		2.25	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	YBL081W	YBL081W	1107 nt		2.25	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	SMY2	YBR172C	2223 nt		2.25	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	MNT3	YIL014W	1893 nt		2.24	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	YDL199C	YDL199C	2064 nt		2.24	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	ORC1	YML065W	2745 nt		2.24	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	TAN1	YGL232W	870 nt		2.24	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	ADH4	YGL256W	1149 nt		2.24	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	MSA2	YKR077W	1092 nt		2.24	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	ILV5	YLR355C	1188 nt		2.24	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	YNL203C	YNL203C	612 nt		2.24	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	JID1	YPR061C	906 nt		2.24	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	YBR209W	YBR209W	318 nt		2.24	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	CET1	YPL228W	1650 nt		2.24	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	IKI3	YLR384C	4050 nt		2.24	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	HUL5	YGL141W	2733 nt		2.24	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	ISW1	YBR245C	3390 nt		2.24	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	YJL132W	YJL132W	2253 nt		2.24	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	RIM13	YMR154C	2184 nt		2.23	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	DUN1	YDL101C	1542 nt		2.23	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	YKU80	YMR106C	1890 nt		2.23	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	NSA2	YER126C	786 nt		2.23	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	YGR114C	YGR114C	390 nt		2.23	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	YGR293C	YGR293C	462 nt		2.23	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	YKL156C-A	YKL156C-A	117 nt		2.23	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	YPR078C	YPR078C	1119 nt		2.23	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	MRP2	YPR166C	348 nt		2.23	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	SIR3	YLR442C	2937 nt		2.23	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	VPS13	YLL040C	9435 nt		2.23	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	DNL4	YOR005C	2835 nt		2.23	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	YGL176C	YGL176C	1665 nt		2.22	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	TOP2	YNL088W	4287 nt		2.22	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	YCK2	YNL154C	1641 nt		2.22	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	FKS3	YMR306W	5358 nt		2.22	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	YDL050C	YDL050C	372 nt		2.22	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	RPL8B	YLL045C	771 nt		2.22	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	YLR311C	YLR311C	348 nt		2.22	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	YLR347W-A	YLR347W-A	141 nt		2.22	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	YMR310C	YMR310C	954 nt		2.22	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	SYC1	YOR179C	567 nt		2.22	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	ATP3	YBR039W	936 nt		2.22	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	PIS1	YPR113W	663 nt		2.22	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	PBS2	YJL128C	2007 nt		2.22	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	NUF2	YOL069W	1356 nt		2.22	□□□□□ -2.05
SHE2	P36068	YDR355C	YDR355C	303 nt		2.21	□□□□□ -2.06
SHE2	P36068	EPT1	YHR123W	1176 nt		2.21	□□□□□ -2.06
SHE2	P36068	YIL054W	YIL054W	318 nt		2.21	□□□□□ -2.06
SHE2	P36068	SNX4	YJL036W	1272 nt		2.21	□□□□□ -2.06
SHE2	P36068	EXO70	YJL085W	1872 nt		2.21	□□□□□ -2.06
SHE2	P36068	MTD1	YKR080W	963 nt		2.21	□□□□□ -2.06
SHE2	P36068	YLR076C	YLR076C	423 nt		2.21	□□□□□ -2.06
SHE2	P36068	PSY3	YLR376C	729 nt		2.21	□□□□□ -2.06
SHE2	P36068	PIN4	YBL051C	2007 nt		2.21	□□□□□ -2.06
SHE2	P36068	COS1	YNL336W	1146 nt		2.21	□□□□□ -2.06
SHE2	P36068	MRPL27	YBR282W	441 nt		2.21	□□□□□ -2.06
SHE2	P36068	PTP3	YER075C	2787 nt		2.21	□□□□□ -2.06
SHE2	P36068	CSF1	YLR087C	8877 nt		2.2	□□□□□ -2.06
SHE2	P36068	RDS2	YPL133C	1341 nt		2.2	□□□□□ -2.06
SHE2	P36068	GCD10	YNL062C	1437 nt		2.2	□□□□□ -2.06
SHE2	P36068	NHP10	YDL002C	612 nt		2.2	□□□□□ -2.06
SHE2	P36068	HTA1	YDR225W	399 nt		2.2	□□□□□ -2.06
SHE2	P36068	LRS4	YDR439W	1044 nt		2.2	□□□□□ -2.06
SHE2	P36068	YGR039W	YGR039W	312 nt		2.2	□□□□□ -2.06
SHE2	P36068	YHR097C	YHR097C	1101 nt		2.2	□□□□□ -2.06
SHE2	P36068	RNR2	YJL026W	1200 nt		2.2	□□□□□ -2.06
SHE2	P36068	COX14	YML129C	213 nt		2.2	□□□□□ -2.06
SHE2	P36068	TRM112	YNR046W	408 nt		2.2	□□□□□ -2.06
SHE2	P36068	RPS10A	YOR293W	318 nt		2.2	□□□□□ -2.06
SHE2	P36068	RRD2	YPL152W	1077 nt		2.2	□□□□□ -2.06
SHE2	P36068	ORC2	YBR060C	1863 nt		2.2	□□□□□ -2.06
SHE2	P36068	PKP2	YGL059W	1476 nt		2.2	□□□□□ -2.06
SHE2	P36068	PDR11	YIL013C	4236 nt		2.19	□□□□□ -2.06
SHE2	P36068	GYL1	YMR192W	2163 nt		2.19	□□□□□ -2.06
SHE2	P36068	TMA64	YDR117C	1698 nt		2.19	□□□□□ -2.06
SHE2	P36068	YEF3	YLR249W	3135 nt		2.19	□□□□□ -2.06
SHE2	P36068	YKL100C	YKL100C	1764 nt		2.19	□□□□□ -2.06
SHE2	P36068	YER066C-A	YER066C-A	501 nt		2.19	□□□□□ -2.06

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