Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNB1P35222 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CTNNB1P35222 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms