Protein–RNA interactions for Protein: P32487

LYP1, Lysine-specific permease, yeast

Predictions only

Length 611 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LYP1	P32487	HMG1	YML075C	3165 nt		4.44	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	RIM21	YNL294C	1602 nt		4.44	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	BNA6	YFR047C	888 nt		4.44	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	YGL039W	YGL039W	1047 nt		4.44	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	MRM2	YGL136C	963 nt		4.44	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	YIR020C	YIR020C	303 nt		4.44	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	RPS4A	YJR145C	786 nt		4.44	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	YBR012C	YBR012C	420 nt		4.44	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	CAT5	YOR125C	702 nt		4.44	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	YOR293C-A	YOR293C-A	150 nt		4.44	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	DER1	YBR201W	636 nt		4.44	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	FAR8	YMR029C	1572 nt		4.44	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	YEH2	YLR020C	1617 nt		4.43	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	CRT10	YOL063C	2874 nt		4.43	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	HNT1	YDL125C	477 nt		4.43	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	RSM24	YDR175C	960 nt		4.43	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	GET1	YGL020C	708 nt		4.43	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	YMR153C-A	YMR153C-A	336 nt		4.43	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	AFT2	YPL202C	1251 nt		4.43	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	YBR103C-A	YBR103C-A	144 nt		4.43	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	YBR201C-A	YBR201C-A	204 nt		4.43	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	DPB3	YBR278W	606 nt		4.43	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	YCL012C	YCL012C	405 nt		4.43	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	SYO1	YDL063C	1863 nt		4.43	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	EXO70	YJL085W	1872 nt		4.43	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	HDA2	YDR295C	2025 nt		4.43	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	MPS3	YJL019W	2049 nt		4.43	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	CBF5	YLR175W	1452 nt		4.43	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	SLK19	YOR195W	2466 nt		4.43	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	RRN11	YML043C	1524 nt		4.42	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	MET12	YPL023C	1974 nt		4.42	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	NUP133	YKR082W	3474 nt		4.42	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	YCR045W-A	YCR045W-A	351 nt		4.42	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	YDR262W	YDR262W	819 nt		4.42	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	YDR269C	YDR269C	324 nt		4.42	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	OTU1	YFL044C	906 nt		4.42	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	YGL108C	YGL108C	423 nt		4.42	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	VMA10	YHR039C-A	345 nt		4.42	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	YIL177W-A	YIL177W-A	483 nt		4.42	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	YJL225W-A	YJL225W-A	483 nt		4.42	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	AFB1	YLR040C	675 nt		4.42	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	IES3	YLR052W	753 nt		4.42	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	YOR248W	YOR248W	303 nt		4.42	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	YPR050C	YPR050C	414 nt		4.42	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	PSP1	YDR505C	2526 nt		4.42	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	VPS9	YML097C	1356 nt		4.41	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	SSH4	YKL124W	1740 nt		4.41	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	MDM36	YPR083W	1740 nt		4.41	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	MTM1	YGR257C	1101 nt		4.41	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	YAP3	YHL009C	993 nt		4.41	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	SWC7	YLR385C	399 nt		4.41	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	YBL071C	YBL071C	309 nt		4.41	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	INO4	YOL108C	456 nt		4.41	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	GMC1	YDR506C	1827 nt		4.41	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	UTP25	YIL091C	2166 nt		4.41	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	SWC4	YGR002C	1431 nt		4.4	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	OAF3	YKR064W	2592 nt		4.4	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	KAR2	YJL034W	2049 nt		4.4	□□□□□ -1.7
LYP1	P32487	CPR5	YDR304C	678 nt		4.4	□□□□□ -1.71
LYP1	P32487	YKL044W	YKL044W	321 nt		4.4	□□□□□ -1.71
LYP1	P32487	YLR224W	YLR224W	1110 nt		4.4	□□□□□ -1.71
LYP1	P32487	CTK3	YML112W	891 nt		4.4	□□□□□ -1.71
LYP1	P32487	GRC3	YLL035W	1899 nt		4.39	□□□□□ -1.71
LYP1	P32487	YPL260W	YPL260W	1656 nt		4.39	□□□□□ -1.71
LYP1	P32487	TPA1	YER049W	1935 nt		4.39	□□□□□ -1.71
LYP1	P32487	snR59	snR59	78 nt		4.39	□□□□□ -1.71
LYP1	P32487	YER079W	YER079W	633 nt		4.39	□□□□□ -1.71
LYP1	P32487	SPI1	YER150W	447 nt		4.39	□□□□□ -1.71
LYP1	P32487	YJL127C-B	YJL127C-B	159 nt		4.39	□□□□□ -1.71
LYP1	P32487	TDA8	YAL064C-A	381 nt		4.39	□□□□□ -1.71
LYP1	P32487	YML003W	YML003W	873 nt		4.39	□□□□□ -1.71
LYP1	P32487	YPT53	YNL093W	663 nt		4.39	□□□□□ -1.71
LYP1	P32487	YNL181W	YNL181W	1224 nt		4.39	□□□□□ -1.71
LYP1	P32487	CBP3	YPL215W	1008 nt		4.39	□□□□□ -1.71
LYP1	P32487	RPC40	YPR110C	1008 nt		4.39	□□□□□ -1.71
LYP1	P32487	RAD54	YGL163C	2697 nt		4.39	□□□□□ -1.71
LYP1	P32487	PEP7	YDR323C	1548 nt		4.39	□□□□□ -1.71
LYP1	P32487	EXO5	YBR163W	1758 nt		4.39	□□□□□ -1.71
LYP1	P32487	SHE4	YOR035C	2370 nt		4.39	□□□□□ -1.71
LYP1	P32487	VBA2	YBR293W	1425 nt		4.38	□□□□□ -1.71
LYP1	P32487	ADY4	YLR227C	1482 nt		4.38	□□□□□ -1.71
LYP1	P32487	BCK2	YER167W	2556 nt		4.38	□□□□□ -1.71
LYP1	P32487	YGL088W	YGL088W	366 nt		4.38	□□□□□ -1.71
LYP1	P32487	PCL5	YHR071W	690 nt		4.38	□□□□□ -1.71
LYP1	P32487	TPM2	YIL138C	486 nt		4.38	□□□□□ -1.71
LYP1	P32487	YBL010C	YBL010C	843 nt		4.38	□□□□□ -1.71
LYP1	P32487	YBR076C-A	YBR076C-A	267 nt		4.38	□□□□□ -1.71
LYP1	P32487	RPL19A	YBR084C-A	570 nt		4.38	□□□□□ -1.71
LYP1	P32487	ASI1	YMR119W	1875 nt		4.38	□□□□□ -1.71
LYP1	P32487	OSH2	YDL019C	3852 nt		4.38	□□□□□ -1.71
LYP1	P32487	NCS2	YNL119W	1482 nt		4.37	□□□□□ -1.71
LYP1	P32487	APC4	YDR118W	1959 nt		4.37	□□□□□ -1.71
LYP1	P32487	YHR138C	YHR138C	345 nt		4.37	□□□□□ -1.71
LYP1	P32487	RPA12	YJR063W	378 nt		4.37	□□□□□ -1.71
LYP1	P32487	YLR428C	YLR428C	345 nt		4.37	□□□□□ -1.71
LYP1	P32487	RPL6B	YLR448W	531 nt		4.37	□□□□□ -1.71
LYP1	P32487	YML084W	YML084W	309 nt		4.37	□□□□□ -1.71
LYP1	P32487	RPS16A	YMR143W	432 nt		4.37	□□□□□ -1.71
LYP1	P32487	YOL159C	YOL159C	516 nt		4.37	□□□□□ -1.71
LYP1	P32487	TGL3	YMR313C	1929 nt		4.36	□□□□□ -1.71

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15 ms