Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC3AP31941 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms