Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPOP30536 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPOP30536 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPOP30536 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPOP30536 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPOP30536 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPOP30536 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPOP30536 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPOP30536 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPOP30536 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPOP30536 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPOP30536 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSPOP30536 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPOP30536 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPOP30536 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPOP30536 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPOP30536 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPOP30536 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPOP30536 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPOP30536 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPOP30536 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPOP30536 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPOP30536 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPOP30536 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPOP30536 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPOP30536 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPOP30536 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPOP30536 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPOP30536 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPOP30536 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPOP30536 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPOP30536 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPOP30536 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPOP30536 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPOP30536 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPOP30536 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPOP30536 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPOP30536 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPOP30536 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPOP30536 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPOP30536 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPOP30536 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPOP30536 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSPOP30536 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPOP30536 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPOP30536 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPOP30536 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPOP30536 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPOP30536 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPOP30536 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPOP30536 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPOP30536 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPOP30536 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPOP30536 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPOP30536 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPOP30536 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPOP30536 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPOP30536 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPOP30536 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPOP30536 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPOP30536 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPOP30536 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPOP30536 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPOP30536 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPOP30536 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSPOP30536 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPOP30536 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPOP30536 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPOP30536 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPOP30536 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPOP30536 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPOP30536 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPOP30536 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPOP30536 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPOP30536 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPOP30536 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPOP30536 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPOP30536 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPOP30536 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPOP30536 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSPOP30536 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSPOP30536 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSPOP30536 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSPOP30536 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSPOP30536 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPOP30536 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPOP30536 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPOP30536 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPOP30536 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPOP30536 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPOP30536 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPOP30536 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPOP30536 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPOP30536 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPOP30536 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPOP30536 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPOP30536 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPOP30536 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPOP30536 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPOP30536 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms