Protein–RNA interactions for Protein: P30307

CDC25C, M-phase inducer phosphatase 3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC25CP30307 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC25CP30307 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms