Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCSK1P29120 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCSK1P29120 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms