Protein–RNA interactions for Protein: P24863

CCNC, Cyclin-C, humanhuman

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNCP24863 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNCP24863 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNCP24863 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNCP24863 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNCP24863 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNCP24863 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNCP24863 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNCP24863 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNCP24863 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNCP24863 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNCP24863 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNCP24863 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNCP24863 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNCP24863 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNCP24863 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNCP24863 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNCP24863 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNCP24863 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNCP24863 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNCP24863 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNCP24863 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNCP24863 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNCP24863 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNCP24863 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNCP24863 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNCP24863 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNCP24863 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNCP24863 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNCP24863 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNCP24863 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNCP24863 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNCP24863 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNCP24863 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNCP24863 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNCP24863 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNCP24863 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNCP24863 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNCP24863 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNCP24863 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNCP24863 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNCP24863 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNCP24863 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNCP24863 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNCP24863 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNCP24863 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNCP24863 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNCP24863 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNCP24863 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNCP24863 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNCP24863 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNCP24863 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNCP24863 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNCP24863 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNCP24863 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNCP24863 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNCP24863 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNCP24863 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNCP24863 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNCP24863 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNCP24863 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNCP24863 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNCP24863 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNCP24863 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNCP24863 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNCP24863 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNCP24863 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNCP24863 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNCP24863 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNCP24863 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNCP24863 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNCP24863 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNCP24863 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNCP24863 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNCP24863 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNCP24863 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNCP24863 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNCP24863 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNCP24863 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNCP24863 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNCP24863 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNCP24863 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNCP24863 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNCP24863 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNCP24863 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNCP24863 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNCP24863 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNCP24863 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNCP24863 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNCP24863 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNCP24863 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNCP24863 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNCP24863 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNCP24863 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNCP24863 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNCP24863 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNCP24863 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNCP24863 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNCP24863 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNCP24863 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNCP24863 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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