Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKACBP22694 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKACBP22694 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms