Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX1P22670 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX1P22670 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX1P22670 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX1P22670 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX1P22670 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX1P22670 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX1P22670 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX1P22670 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX1P22670 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX1P22670 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX1P22670 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX1P22670 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX1P22670 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFX1P22670 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFX1P22670 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFX1P22670 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFX1P22670 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFX1P22670 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFX1P22670 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFX1P22670 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFX1P22670 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFX1P22670 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFX1P22670 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFX1P22670 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFX1P22670 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFX1P22670 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFX1P22670 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX1P22670 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX1P22670 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX1P22670 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX1P22670 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX1P22670 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX1P22670 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX1P22670 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX1P22670 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX1P22670 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX1P22670 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX1P22670 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX1P22670 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX1P22670 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX1P22670 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX1P22670 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX1P22670 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX1P22670 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX1P22670 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX1P22670 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX1P22670 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX1P22670 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX1P22670 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX1P22670 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX1P22670 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX1P22670 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX1P22670 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX1P22670 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX1P22670 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX1P22670 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX1P22670 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX1P22670 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX1P22670 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX1P22670 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX1P22670 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX1P22670 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX1P22670 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX1P22670 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX1P22670 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX1P22670 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX1P22670 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX1P22670 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX1P22670 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX1P22670 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX1P22670 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX1P22670 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX1P22670 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX1P22670 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RFX1P22670 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RFX1P22670 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RFX1P22670 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RFX1P22670 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RFX1P22670 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFX1P22670 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFX1P22670 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFX1P22670 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFX1P22670 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFX1P22670 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFX1P22670 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFX1P22670 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFX1P22670 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFX1P22670 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX1P22670 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX1P22670 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX1P22670 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX1P22670 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX1P22670 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX1P22670 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX1P22670 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX1P22670 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX1P22670 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX1P22670 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX1P22670 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms