Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms