Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGFR4P22455 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGFR4P22455 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGFR4P22455 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms