Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTF3P20783 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTF3P20783 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTF3P20783 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTF3P20783 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTF3P20783 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTF3P20783 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTF3P20783 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTF3P20783 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NTF3P20783 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTF3P20783 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NTF3P20783 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTF3P20783 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NTF3P20783 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTF3P20783 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTF3P20783 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTF3P20783 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTF3P20783 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTF3P20783 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NTF3P20783 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTF3P20783 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NTF3P20783 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NTF3P20783 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NTF3P20783 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NTF3P20783 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NTF3P20783 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NTF3P20783 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NTF3P20783 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTF3P20783 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTF3P20783 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTF3P20783 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTF3P20783 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTF3P20783 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTF3P20783 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTF3P20783 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTF3P20783 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTF3P20783 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTF3P20783 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTF3P20783 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NTF3P20783 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTF3P20783 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTF3P20783 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTF3P20783 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NTF3P20783 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTF3P20783 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTF3P20783 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTF3P20783 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTF3P20783 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTF3P20783 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTF3P20783 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTF3P20783 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTF3P20783 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTF3P20783 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTF3P20783 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTF3P20783 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NTF3P20783 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTF3P20783 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTF3P20783 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTF3P20783 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTF3P20783 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTF3P20783 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTF3P20783 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTF3P20783 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTF3P20783 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTF3P20783 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTF3P20783 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NTF3P20783 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTF3P20783 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTF3P20783 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTF3P20783 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTF3P20783 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTF3P20783 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTF3P20783 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NTF3P20783 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTF3P20783 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTF3P20783 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTF3P20783 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTF3P20783 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NTF3P20783 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NTF3P20783 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NTF3P20783 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NTF3P20783 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NTF3P20783 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NTF3P20783 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NTF3P20783 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NTF3P20783 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NTF3P20783 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NTF3P20783 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NTF3P20783 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NTF3P20783 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NTF3P20783 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NTF3P20783 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NTF3P20783 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NTF3P20783 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NTF3P20783 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NTF3P20783 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NTF3P20783 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NTF3P20783 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NTF3P20783 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NTF3P20783 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms