Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRHP20396 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRHP20396 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRHP20396 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRHP20396 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRHP20396 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRHP20396 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRHP20396 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRHP20396 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRHP20396 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRHP20396 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRHP20396 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRHP20396 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRHP20396 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRHP20396 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
TRHP20396 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRHP20396 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRHP20396 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
TRHP20396 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TRHP20396 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TRHP20396 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TRHP20396 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TRHP20396 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TRHP20396 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TRHP20396 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TRHP20396 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TRHP20396 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
TRHP20396 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TRHP20396 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TRHP20396 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TRHP20396 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TRHP20396 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TRHP20396 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TRHP20396 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TRHP20396 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TRHP20396 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TRHP20396 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
TRHP20396 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
TRHP20396 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRHP20396 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRHP20396 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRHP20396 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
TRHP20396 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRHP20396 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRHP20396 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRHP20396 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRHP20396 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TRHP20396 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TRHP20396 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
TRHP20396 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
TRHP20396 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TRHP20396 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TRHP20396 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TRHP20396 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TRHP20396 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TRHP20396 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRHP20396 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRHP20396 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRHP20396 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRHP20396 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRHP20396 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRHP20396 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRHP20396 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRHP20396 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRHP20396 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TRHP20396 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TRHP20396 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TRHP20396 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TRHP20396 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TRHP20396 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TRHP20396 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
TRHP20396 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TRHP20396 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
TRHP20396 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TRHP20396 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TRHP20396 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TRHP20396 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TRHP20396 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TRHP20396 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
TRHP20396 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TRHP20396 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TRHP20396 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TRHP20396 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TRHP20396 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TRHP20396 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TRHP20396 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TRHP20396 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TRHP20396 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TRHP20396 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TRHP20396 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TRHP20396 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TRHP20396 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TRHP20396 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TRHP20396 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TRHP20396 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TRHP20396 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TRHP20396 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TRHP20396 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TRHP20396 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TRHP20396 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms