Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARF4P18085 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARF4P18085 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARF4P18085 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARF4P18085 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARF4P18085 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARF4P18085 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARF4P18085 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARF4P18085 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ARF4P18085 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARF4P18085 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARF4P18085 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARF4P18085 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARF4P18085 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARF4P18085 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARF4P18085 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARF4P18085 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARF4P18085 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARF4P18085 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARF4P18085 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARF4P18085 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARF4P18085 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARF4P18085 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARF4P18085 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARF4P18085 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARF4P18085 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARF4P18085 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARF4P18085 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARF4P18085 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARF4P18085 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARF4P18085 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARF4P18085 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARF4P18085 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARF4P18085 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARF4P18085 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARF4P18085 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARF4P18085 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARF4P18085 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARF4P18085 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARF4P18085 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARF4P18085 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARF4P18085 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARF4P18085 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ARF4P18085 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARF4P18085 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARF4P18085 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARF4P18085 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ARF4P18085 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARF4P18085 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARF4P18085 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ARF4P18085 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARF4P18085 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARF4P18085 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARF4P18085 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARF4P18085 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARF4P18085 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARF4P18085 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ARF4P18085 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ARF4P18085 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARF4P18085 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARF4P18085 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARF4P18085 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARF4P18085 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ARF4P18085 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARF4P18085 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARF4P18085 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARF4P18085 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARF4P18085 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARF4P18085 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARF4P18085 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARF4P18085 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARF4P18085 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARF4P18085 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARF4P18085 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARF4P18085 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARF4P18085 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARF4P18085 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARF4P18085 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARF4P18085 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARF4P18085 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARF4P18085 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARF4P18085 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARF4P18085 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARF4P18085 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARF4P18085 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARF4P18085 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARF4P18085 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARF4P18085 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARF4P18085 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARF4P18085 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARF4P18085 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ARF4P18085 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARF4P18085 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARF4P18085 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ARF4P18085 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARF4P18085 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARF4P18085 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARF4P18085 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARF4P18085 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARF4P18085 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms