Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DESP17661 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DESP17661 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DESP17661 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DESP17661 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DESP17661 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DESP17661 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DESP17661 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DESP17661 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DESP17661 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DESP17661 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DESP17661 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DESP17661 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DESP17661 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DESP17661 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DESP17661 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DESP17661 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DESP17661 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DESP17661 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DESP17661 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DESP17661 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DESP17661 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DESP17661 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DESP17661 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DESP17661 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DESP17661 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DESP17661 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DESP17661 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DESP17661 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DESP17661 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DESP17661 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DESP17661 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DESP17661 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DESP17661 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DESP17661 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DESP17661 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DESP17661 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DESP17661 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DESP17661 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DESP17661 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DESP17661 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DESP17661 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DESP17661 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DESP17661 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DESP17661 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DESP17661 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DESP17661 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DESP17661 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DESP17661 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DESP17661 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DESP17661 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DESP17661 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DESP17661 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DESP17661 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DESP17661 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DESP17661 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DESP17661 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DESP17661 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DESP17661 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DESP17661 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DESP17661 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DESP17661 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DESP17661 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DESP17661 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DESP17661 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DESP17661 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DESP17661 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DESP17661 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DESP17661 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DESP17661 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DESP17661 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DESP17661 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DESP17661 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DESP17661 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DESP17661 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DESP17661 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DESP17661 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DESP17661 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DESP17661 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DESP17661 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DESP17661 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DESP17661 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DESP17661 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DESP17661 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DESP17661 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DESP17661 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DESP17661 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DESP17661 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DESP17661 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DESP17661 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DESP17661 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DESP17661 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DESP17661 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DESP17661 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DESP17661 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DESP17661 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DESP17661 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DESP17661 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DESP17661 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DESP17661 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms