Protein–RNA interactions for Protein: P14314

PRKCSH, Glucosidase 2 subunit beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCSHP14314 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRKCSHP14314 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms