Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SLC5A1P13866 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC5A1P13866 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms