Protein–RNA interactions for Protein: P13796

LCP1, Plastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1P13796 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCP1P13796 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCP1P13796 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCP1P13796 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCP1P13796 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCP1P13796 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCP1P13796 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCP1P13796 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCP1P13796 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCP1P13796 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCP1P13796 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCP1P13796 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCP1P13796 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCP1P13796 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LCP1P13796 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCP1P13796 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCP1P13796 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCP1P13796 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCP1P13796 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCP1P13796 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCP1P13796 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCP1P13796 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCP1P13796 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCP1P13796 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCP1P13796 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCP1P13796 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCP1P13796 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCP1P13796 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCP1P13796 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LCP1P13796 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCP1P13796 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCP1P13796 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCP1P13796 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCP1P13796 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCP1P13796 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCP1P13796 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCP1P13796 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCP1P13796 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCP1P13796 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCP1P13796 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCP1P13796 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LCP1P13796 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCP1P13796 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCP1P13796 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCP1P13796 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCP1P13796 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCP1P13796 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LCP1P13796 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCP1P13796 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCP1P13796 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCP1P13796 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCP1P13796 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCP1P13796 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LCP1P13796 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCP1P13796 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCP1P13796 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCP1P13796 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCP1P13796 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LCP1P13796 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCP1P13796 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCP1P13796 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCP1P13796 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCP1P13796 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LCP1P13796 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCP1P13796 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCP1P13796 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCP1P13796 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCP1P13796 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCP1P13796 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCP1P13796 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCP1P13796 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCP1P13796 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCP1P13796 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCP1P13796 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCP1P13796 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCP1P13796 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCP1P13796 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCP1P13796 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCP1P13796 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCP1P13796 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCP1P13796 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCP1P13796 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCP1P13796 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LCP1P13796 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LCP1P13796 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCP1P13796 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCP1P13796 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCP1P13796 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCP1P13796 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCP1P13796 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCP1P13796 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCP1P13796 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCP1P13796 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCP1P13796 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCP1P13796 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCP1P13796 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCP1P13796 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCP1P13796 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCP1P13796 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCP1P13796 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms