Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCG2P13521 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCG2P13521 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCG2P13521 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SCG2P13521 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCG2P13521 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCG2P13521 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCG2P13521 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCG2P13521 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SCG2P13521 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCG2P13521 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCG2P13521 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCG2P13521 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCG2P13521 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SCG2P13521 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCG2P13521 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCG2P13521 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCG2P13521 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCG2P13521 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCG2P13521 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCG2P13521 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCG2P13521 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCG2P13521 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCG2P13521 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCG2P13521 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCG2P13521 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCG2P13521 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCG2P13521 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCG2P13521 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCG2P13521 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCG2P13521 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCG2P13521 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCG2P13521 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCG2P13521 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCG2P13521 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCG2P13521 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCG2P13521 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCG2P13521 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCG2P13521 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCG2P13521 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCG2P13521 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCG2P13521 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCG2P13521 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCG2P13521 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCG2P13521 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCG2P13521 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCG2P13521 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCG2P13521 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCG2P13521 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCG2P13521 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCG2P13521 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCG2P13521 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCG2P13521 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCG2P13521 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCG2P13521 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCG2P13521 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCG2P13521 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCG2P13521 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCG2P13521 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCG2P13521 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCG2P13521 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SCG2P13521 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCG2P13521 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCG2P13521 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCG2P13521 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCG2P13521 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SCG2P13521 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCG2P13521 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCG2P13521 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCG2P13521 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCG2P13521 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SCG2P13521 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCG2P13521 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCG2P13521 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCG2P13521 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCG2P13521 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCG2P13521 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCG2P13521 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCG2P13521 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCG2P13521 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCG2P13521 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCG2P13521 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCG2P13521 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCG2P13521 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCG2P13521 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SCG2P13521 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCG2P13521 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCG2P13521 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCG2P13521 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCG2P13521 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCG2P13521 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCG2P13521 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCG2P13521 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SCG2P13521 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SCG2P13521 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCG2P13521 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCG2P13521 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCG2P13521 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCG2P13521 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCG2P13521 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms