Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DEFA4P12838 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DEFA4P12838 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DEFA4P12838 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DEFA4P12838 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DEFA4P12838 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DEFA4P12838 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DEFA4P12838 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DEFA4P12838 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DEFA4P12838 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEFA4P12838 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEFA4P12838 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEFA4P12838 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEFA4P12838 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEFA4P12838 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms