Protein–RNA interactions for Protein: P11171

EPB41, Protein 4.1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41P11171 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPB41P11171 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EPB41P11171 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPB41P11171 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPB41P11171 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPB41P11171 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPB41P11171 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPB41P11171 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EPB41P11171 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPB41P11171 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPB41P11171 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPB41P11171 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPB41P11171 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPB41P11171 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPB41P11171 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPB41P11171 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPB41P11171 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPB41P11171 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPB41P11171 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPB41P11171 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPB41P11171 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPB41P11171 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPB41P11171 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPB41P11171 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPB41P11171 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPB41P11171 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPB41P11171 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPB41P11171 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPB41P11171 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPB41P11171 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPB41P11171 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPB41P11171 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPB41P11171 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPB41P11171 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPB41P11171 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPB41P11171 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPB41P11171 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPB41P11171 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPB41P11171 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPB41P11171 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPB41P11171 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPB41P11171 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPB41P11171 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPB41P11171 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPB41P11171 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPB41P11171 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPB41P11171 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPB41P11171 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPB41P11171 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPB41P11171 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPB41P11171 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPB41P11171 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPB41P11171 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPB41P11171 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EPB41P11171 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EPB41P11171 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPB41P11171 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPB41P11171 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPB41P11171 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EPB41P11171 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPB41P11171 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPB41P11171 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPB41P11171 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPB41P11171 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPB41P11171 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPB41P11171 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPB41P11171 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPB41P11171 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPB41P11171 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPB41P11171 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EPB41P11171 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPB41P11171 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPB41P11171 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPB41P11171 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPB41P11171 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPB41P11171 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPB41P11171 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPB41P11171 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPB41P11171 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPB41P11171 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPB41P11171 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EPB41P11171 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPB41P11171 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPB41P11171 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPB41P11171 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPB41P11171 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPB41P11171 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPB41P11171 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPB41P11171 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPB41P11171 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPB41P11171 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPB41P11171 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EPB41P11171 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPB41P11171 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPB41P11171 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EPB41P11171 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPB41P11171 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPB41P11171 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPB41P11171 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EPB41P11171 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms