Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF1P10914 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF1P10914 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF1P10914 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF1P10914 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRF1P10914 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IRF1P10914 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
IRF1P10914 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IRF1P10914 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
IRF1P10914 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF1P10914 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF1P10914 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF1P10914 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF1P10914 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF1P10914 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF1P10914 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF1P10914 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF1P10914 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF1P10914 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF1P10914 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF1P10914 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRF1P10914 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF1P10914 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF1P10914 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF1P10914 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF1P10914 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF1P10914 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF1P10914 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF1P10914 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF1P10914 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF1P10914 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF1P10914 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF1P10914 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRF1P10914 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF1P10914 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF1P10914 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF1P10914 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF1P10914 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF1P10914 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF1P10914 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF1P10914 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF1P10914 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF1P10914 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF1P10914 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF1P10914 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF1P10914 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF1P10914 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF1P10914 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRF1P10914 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRF1P10914 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRF1P10914 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRF1P10914 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRF1P10914 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRF1P10914 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRF1P10914 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRF1P10914 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRF1P10914 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRF1P10914 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRF1P10914 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRF1P10914 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRF1P10914 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRF1P10914 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRF1P10914 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRF1P10914 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRF1P10914 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRF1P10914 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRF1P10914 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRF1P10914 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRF1P10914 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRF1P10914 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRF1P10914 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRF1P10914 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
IRF1P10914 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
IRF1P10914 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
IRF1P10914 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRF1P10914 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRF1P10914 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF1P10914 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF1P10914 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF1P10914 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF1P10914 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF1P10914 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF1P10914 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF1P10914 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF1P10914 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF1P10914 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF1P10914 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF1P10914 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF1P10914 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRF1P10914 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRF1P10914 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRF1P10914 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRF1P10914 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRF1P10914 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRF1P10914 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRF1P10914 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IRF1P10914 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IRF1P10914 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
IRF1P10914 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IRF1P10914 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms