Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC192P0DO97 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC192P0DO97 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms