Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M4

RHOXF2B, Rhox homeobox family member 2B, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2BP0C7M4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOXF2BP0C7M4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOXF2BP0C7M4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOXF2BP0C7M4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOXF2BP0C7M4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOXF2BP0C7M4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOXF2BP0C7M4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOXF2BP0C7M4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOXF2BP0C7M4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOXF2BP0C7M4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOXF2BP0C7M4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOXF2BP0C7M4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOXF2BP0C7M4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOXF2BP0C7M4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOXF2BP0C7M4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOXF2BP0C7M4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOXF2BP0C7M4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOXF2BP0C7M4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOXF2BP0C7M4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOXF2BP0C7M4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOXF2BP0C7M4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOXF2BP0C7M4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOXF2BP0C7M4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOXF2BP0C7M4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOXF2BP0C7M4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOXF2BP0C7M4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOXF2BP0C7M4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOXF2BP0C7M4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOXF2BP0C7M4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOXF2BP0C7M4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOXF2BP0C7M4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOXF2BP0C7M4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOXF2BP0C7M4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOXF2BP0C7M4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOXF2BP0C7M4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOXF2BP0C7M4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOXF2BP0C7M4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOXF2BP0C7M4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOXF2BP0C7M4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHOXF2BP0C7M4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHOXF2BP0C7M4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHOXF2BP0C7M4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHOXF2BP0C7M4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHOXF2BP0C7M4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOXF2BP0C7M4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms