Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SFTA3P0C7M3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFTA3P0C7M3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFTA3P0C7M3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFTA3P0C7M3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFTA3P0C7M3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFTA3P0C7M3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFTA3P0C7M3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFTA3P0C7M3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFTA3P0C7M3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFTA3P0C7M3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFTA3P0C7M3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFTA3P0C7M3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFTA3P0C7M3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFTA3P0C7M3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFTA3P0C7M3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFTA3P0C7M3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFTA3P0C7M3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFTA3P0C7M3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFTA3P0C7M3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFTA3P0C7M3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFTA3P0C7M3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFTA3P0C7M3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFTA3P0C7M3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFTA3P0C7M3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFTA3P0C7M3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFTA3P0C7M3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFTA3P0C7M3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFTA3P0C7M3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFTA3P0C7M3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFTA3P0C7M3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFTA3P0C7M3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFTA3P0C7M3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFTA3P0C7M3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFTA3P0C7M3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFTA3P0C7M3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFTA3P0C7M3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFTA3P0C7M3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFTA3P0C7M3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFTA3P0C7M3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms