Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PARP1P09874 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARP1P09874 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARP1P09874 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARP1P09874 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PARP1P09874 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PARP1P09874 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PARP1P09874 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PARP1P09874 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PARP1P09874 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PARP1P09874 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PARP1P09874 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PARP1P09874 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PARP1P09874 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PARP1P09874 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARP1P09874 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARP1P09874 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARP1P09874 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARP1P09874 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARP1P09874 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARP1P09874 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PARP1P09874 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARP1P09874 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARP1P09874 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PARP1P09874 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARP1P09874 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARP1P09874 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PARP1P09874 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP1P09874 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP1P09874 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP1P09874 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP1P09874 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP1P09874 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP1P09874 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP1P09874 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP1P09874 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP1P09874 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP1P09874 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP1P09874 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP1P09874 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP1P09874 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP1P09874 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PARP1P09874 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP1P09874 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP1P09874 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP1P09874 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP1P09874 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP1P09874 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP1P09874 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP1P09874 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP1P09874 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP1P09874 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP1P09874 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP1P09874 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP1P09874 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP1P09874 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP1P09874 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP1P09874 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP1P09874 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP1P09874 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP1P09874 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP1P09874 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP1P09874 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP1P09874 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP1P09874 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP1P09874 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP1P09874 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP1P09874 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP1P09874 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP1P09874 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP1P09874 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP1P09874 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP1P09874 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PARP1P09874 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARP1P09874 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARP1P09874 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARP1P09874 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARP1P09874 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PARP1P09874 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARP1P09874 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARP1P09874 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARP1P09874 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PARP1P09874 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARP1P09874 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARP1P09874 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARP1P09874 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARP1P09874 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARP1P09874 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARP1P09874 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARP1P09874 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARP1P09874 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARP1P09874 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARP1P09874 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARP1P09874 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARP1P09874 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARP1P09874 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PARP1P09874 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PARP1P09874 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PARP1P09874 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PARP1P09874 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms