Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SRPRAP08240 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SRPRAP08240 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SRPRAP08240 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SRPRAP08240 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRPRAP08240 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SRPRAP08240 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRPRAP08240 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRPRAP08240 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SRPRAP08240 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SRPRAP08240 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SRPRAP08240 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SRPRAP08240 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SRPRAP08240 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SRPRAP08240 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SRPRAP08240 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRPRAP08240 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRPRAP08240 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SRPRAP08240 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRPRAP08240 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRPRAP08240 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SRPRAP08240 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SRPRAP08240 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SRPRAP08240 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRPRAP08240 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SRPRAP08240 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SRPRAP08240 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SRPRAP08240 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SRPRAP08240 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SRPRAP08240 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SRPRAP08240 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms