Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPM2P07951 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPM2P07951 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPM2P07951 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TPM2P07951 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPM2P07951 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPM2P07951 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPM2P07951 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPM2P07951 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPM2P07951 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPM2P07951 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPM2P07951 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPM2P07951 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPM2P07951 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPM2P07951 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPM2P07951 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPM2P07951 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPM2P07951 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPM2P07951 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPM2P07951 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPM2P07951 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPM2P07951 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TPM2P07951 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPM2P07951 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPM2P07951 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPM2P07951 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPM2P07951 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPM2P07951 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPM2P07951 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPM2P07951 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPM2P07951 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPM2P07951 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPM2P07951 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPM2P07951 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPM2P07951 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPM2P07951 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPM2P07951 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPM2P07951 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TPM2P07951 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TPM2P07951 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TPM2P07951 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TPM2P07951 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TPM2P07951 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TPM2P07951 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TPM2P07951 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TPM2P07951 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TPM2P07951 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TPM2P07951 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TPM2P07951 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TPM2P07951 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TPM2P07951 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPM2P07951 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPM2P07951 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPM2P07951 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPM2P07951 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPM2P07951 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPM2P07951 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPM2P07951 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPM2P07951 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPM2P07951 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TPM2P07951 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPM2P07951 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPM2P07951 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPM2P07951 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPM2P07951 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPM2P07951 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPM2P07951 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPM2P07951 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPM2P07951 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPM2P07951 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPM2P07951 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TPM2P07951 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TPM2P07951 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TPM2P07951 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TPM2P07951 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TPM2P07951 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TPM2P07951 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TPM2P07951 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TPM2P07951 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TPM2P07951 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TPM2P07951 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TPM2P07951 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TPM2P07951 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TPM2P07951 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TPM2P07951 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TPM2P07951 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPM2P07951 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPM2P07951 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPM2P07951 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPM2P07951 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPM2P07951 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPM2P07951 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPM2P07951 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPM2P07951 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPM2P07951 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPM2P07951 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPM2P07951 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPM2P07951 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TPM2P07951 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TPM2P07951 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms