Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VTNP04004 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VTNP04004 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VTNP04004 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VTNP04004 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VTNP04004 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VTNP04004 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VTNP04004 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VTNP04004 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VTNP04004 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VTNP04004 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VTNP04004 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VTNP04004 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VTNP04004 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VTNP04004 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VTNP04004 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VTNP04004 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VTNP04004 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VTNP04004 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VTNP04004 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VTNP04004 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VTNP04004 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VTNP04004 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VTNP04004 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VTNP04004 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VTNP04004 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VTNP04004 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VTNP04004 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VTNP04004 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VTNP04004 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VTNP04004 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VTNP04004 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VTNP04004 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VTNP04004 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VTNP04004 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VTNP04004 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VTNP04004 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VTNP04004 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VTNP04004 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VTNP04004 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VTNP04004 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VTNP04004 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VTNP04004 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VTNP04004 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VTNP04004 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VTNP04004 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VTNP04004 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VTNP04004 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VTNP04004 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VTNP04004 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VTNP04004 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VTNP04004 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VTNP04004 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VTNP04004 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VTNP04004 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VTNP04004 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VTNP04004 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VTNP04004 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
VTNP04004 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VTNP04004 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VTNP04004 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VTNP04004 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VTNP04004 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VTNP04004 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
VTNP04004 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VTNP04004 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VTNP04004 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VTNP04004 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
VTNP04004 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VTNP04004 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VTNP04004 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VTNP04004 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VTNP04004 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VTNP04004 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VTNP04004 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VTNP04004 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VTNP04004 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VTNP04004 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VTNP04004 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VTNP04004 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VTNP04004 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VTNP04004 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VTNP04004 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VTNP04004 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VTNP04004 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VTNP04004 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VTNP04004 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VTNP04004 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
VTNP04004 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
VTNP04004 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VTNP04004 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VTNP04004 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VTNP04004 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VTNP04004 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VTNP04004 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VTNP04004 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VTNP04004 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VTNP04004 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VTNP04004 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VTNP04004 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms