Protein–RNA interactions for Protein: P01624

IGKV3-15, Immunoglobulin kappa variable 3-15, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-15P01624 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV3-15P01624 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV3-15P01624 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV3-15P01624 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV3-15P01624 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV3-15P01624 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV3-15P01624 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV3-15P01624 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGKV3-15P01624 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGKV3-15P01624 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGKV3-15P01624 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGKV3-15P01624 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGKV3-15P01624 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGKV3-15P01624 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGKV3-15P01624 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGKV3-15P01624 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
IGKV3-15P01624 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
IGKV3-15P01624 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
IGKV3-15P01624 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV3-15P01624 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms