Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
F9P00740 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
F9P00740 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
F9P00740 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
F9P00740 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
F9P00740 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
F9P00740 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
F9P00740 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
F9P00740 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
F9P00740 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
F9P00740 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
F9P00740 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
F9P00740 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
F9P00740 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
F9P00740 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
F9P00740 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
F9P00740 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
F9P00740 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
F9P00740 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
F9P00740 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
F9P00740 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
F9P00740 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
F9P00740 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
F9P00740 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
F9P00740 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
F9P00740 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
F9P00740 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
F9P00740 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
F9P00740 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
F9P00740 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
F9P00740 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
F9P00740 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
F9P00740 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
F9P00740 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
F9P00740 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
F9P00740 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
F9P00740 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
F9P00740 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
F9P00740 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
F9P00740 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
F9P00740 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
F9P00740 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
F9P00740 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
F9P00740 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
F9P00740 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
F9P00740 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
F9P00740 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
F9P00740 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
F9P00740 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
F9P00740 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
F9P00740 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
F9P00740 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
F9P00740 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
F9P00740 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
F9P00740 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
F9P00740 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
F9P00740 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
F9P00740 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
F9P00740 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
F9P00740 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
F9P00740 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
F9P00740 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
F9P00740 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
F9P00740 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
F9P00740 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
F9P00740 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
F9P00740 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
F9P00740 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
F9P00740 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
F9P00740 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
F9P00740 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
F9P00740 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
F9P00740 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
F9P00740 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
F9P00740 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
F9P00740 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
F9P00740 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
F9P00740 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
F9P00740 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
F9P00740 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
F9P00740 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
F9P00740 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
F9P00740 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
F9P00740 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
F9P00740 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
F9P00740 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
F9P00740 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
F9P00740 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
F9P00740 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
F9P00740 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
F9P00740 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
F9P00740 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
F9P00740 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
F9P00740 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
F9P00740 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
F9P00740 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
F9P00740 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
F9P00740 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
F9P00740 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
F9P00740 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms