Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZBED1O96006 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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