Protein–RNA interactions for Protein: O95473

SYNGR4, Synaptogyrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR4O95473 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SYNGR4O95473 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYNGR4O95473 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms