Protein–RNA interactions for Protein: O95263

PDE8B, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8BO95263 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE8BO95263 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE8BO95263 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE8BO95263 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE8BO95263 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE8BO95263 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE8BO95263 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE8BO95263 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE8BO95263 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE8BO95263 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE8BO95263 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE8BO95263 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE8BO95263 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE8BO95263 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE8BO95263 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE8BO95263 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE8BO95263 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE8BO95263 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE8BO95263 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE8BO95263 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE8BO95263 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE8BO95263 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE8BO95263 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE8BO95263 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE8BO95263 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE8BO95263 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE8BO95263 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE8BO95263 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE8BO95263 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE8BO95263 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE8BO95263 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE8BO95263 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE8BO95263 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE8BO95263 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE8BO95263 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE8BO95263 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE8BO95263 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms