Protein–RNA interactions for Protein: O95197

RTN3, Reticulon-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN3O95197 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN3O95197 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN3O95197 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN3O95197 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN3O95197 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN3O95197 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN3O95197 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN3O95197 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN3O95197 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN3O95197 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN3O95197 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN3O95197 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN3O95197 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTN3O95197 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN3O95197 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN3O95197 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN3O95197 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN3O95197 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN3O95197 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN3O95197 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN3O95197 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN3O95197 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN3O95197 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN3O95197 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTN3O95197 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RTN3O95197 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RTN3O95197 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN3O95197 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN3O95197 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN3O95197 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN3O95197 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN3O95197 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN3O95197 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN3O95197 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN3O95197 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN3O95197 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN3O95197 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN3O95197 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN3O95197 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN3O95197 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN3O95197 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN3O95197 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN3O95197 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN3O95197 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN3O95197 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN3O95197 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN3O95197 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN3O95197 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN3O95197 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN3O95197 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN3O95197 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN3O95197 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTN3O95197 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN3O95197 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN3O95197 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN3O95197 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN3O95197 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN3O95197 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN3O95197 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN3O95197 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN3O95197 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN3O95197 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN3O95197 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN3O95197 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN3O95197 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN3O95197 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN3O95197 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTN3O95197 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN3O95197 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN3O95197 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN3O95197 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN3O95197 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN3O95197 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN3O95197 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN3O95197 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN3O95197 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN3O95197 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN3O95197 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN3O95197 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN3O95197 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN3O95197 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN3O95197 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RTN3O95197 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN3O95197 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN3O95197 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN3O95197 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN3O95197 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN3O95197 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN3O95197 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN3O95197 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN3O95197 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN3O95197 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN3O95197 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN3O95197 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN3O95197 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RTN3O95197 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN3O95197 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN3O95197 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN3O95197 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN3O95197 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms