Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SKAP2O75563 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKAP2O75563 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms